Phan Chí Thanh sinh ngày 20 tháng 7 năm 1958, quê quán tại xã Hiệp Hoà, huyện Đức Hòa, tỉnh Long An.

Ông có trình độ học vấn cử nhân Đại học chuyên ngành Cảnh sát điều tra.

Ông là đảng viên Đảng Cộng sản Việt Nam, có chứng chỉ cao cấp lí luận chính trị của đảng này.[2]

Tháng 11 năm 2012, Phan Chí Thanh là Đại tá, Giám đốc Công an tỉnh Long An.[3]

Năm 2018, Thiếu tướng Phan Chí Thanh nghỉ hưu theo chế độ. Thay thế ông làm Giám đốc Công an tỉnh Long An là Đại tá Lê Hồng Nam, Phó Cục trưởng C03, Bộ Công an.